MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 plasmid pALIDE201

Total Repeats: 1504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015423	GCA	2	6	23663	23668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827352
502	NC_015423	CAA	2	6	23675	23680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827352
503	NC_015423	A	6	6	23679	23684	100 %	0 %	0 %	0 %	330827352
504	NC_015423	CTA	2	6	23693	23698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827352
505	NC_015423	CT	4	8	23712	23719	0 %	50 %	0 %	50 %	330827353
506	NC_015423	CTG	2	6	23732	23737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827353
507	NC_015423	CG	4	8	23752	23759	0 %	0 %	50 %	50 %	330827353
508	NC_015423	ACG	2	6	23796	23801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827353
509	NC_015423	GCG	2	6	23835	23840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827353
510	NC_015423	GCT	2	6	23896	23901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827353
511	NC_015423	TCA	2	6	23916	23921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827353
512	NC_015423	AAG	2	6	23969	23974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827353
513	NC_015423	ACT	2	6	24027	24032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827353
514	NC_015423	ATG	2	6	24072	24077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827354
515	NC_015423	CTG	2	6	24093	24098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827354
516	NC_015423	CTG	2	6	24102	24107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827354
517	NC_015423	TGCGA	2	10	24156	24165	20 %	20 %	40 %	20 %	330827354
518	NC_015423	CCGGCA	2	12	24225	24236	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330827354
519	NC_015423	GCA	2	6	24239	24244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827354
520	NC_015423	CCG	2	6	24298	24303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827354
521	NC_015423	TGA	2	6	24346	24351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827354
522	NC_015423	GGC	2	6	24433	24438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827354
523	NC_015423	ACG	2	6	24511	24516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827354
524	NC_015423	TCT	3	9	24577	24585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330827354
525	NC_015423	TGC	2	6	24661	24666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827354
526	NC_015423	CG	3	6	24720	24725	0 %	0 %	50 %	50 %	330827354
527	NC_015423	ATG	2	6	24813	24818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827354
528	NC_015423	A	6	6	24904	24909	100 %	0 %	0 %	0 %	330827355
529	NC_015423	CAC	2	6	24939	24944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827355
530	NC_015423	CTAC	2	8	24947	24954	25 %	25 %	0 %	50 %	330827355
531	NC_015423	TGC	2	6	25019	25024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827355
532	NC_015423	CGC	2	6	25106	25111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827355
533	NC_015423	GCG	2	6	25130	25135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827355
534	NC_015423	GGC	2	6	25153	25158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827355
535	NC_015423	TCA	2	6	25166	25171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827355
536	NC_015423	TGC	2	6	25193	25198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827355
537	NC_015423	GGC	2	6	25335	25340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827355
538	NC_015423	CG	3	6	25379	25384	0 %	0 %	50 %	50 %	330827355
539	NC_015423	GCAA	2	8	25385	25392	50 %	0 %	25 %	25 %	330827355
540	NC_015423	TGA	2	6	25460	25465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827355
541	NC_015423	CGG	2	6	25499	25504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827355
542	NC_015423	GC	3	6	25508	25513	0 %	0 %	50 %	50 %	330827355
543	NC_015423	AAG	2	6	25567	25572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827355
544	NC_015423	CGA	2	6	25587	25592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827355
545	NC_015423	GAT	2	6	25614	25619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827355
546	NC_015423	GCA	2	6	25622	25627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827355
547	NC_015423	GCT	2	6	25668	25673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827355
548	NC_015423	TGG	2	6	25700	25705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827355
549	NC_015423	ACC	2	6	25714	25719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827355
550	NC_015423	ACC	2	6	25756	25761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827355
551	NC_015423	GCT	2	6	25772	25777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827355
552	NC_015423	CCGA	2	8	25783	25790	25 %	0 %	25 %	50 %	330827355
553	NC_015423	ACC	2	6	25801	25806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827355
554	NC_015423	A	6	6	25841	25846	100 %	0 %	0 %	0 %	330827355
555	NC_015423	ACG	2	6	25877	25882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827355
556	NC_015423	GGC	2	6	25887	25892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827355
557	NC_015423	GAC	2	6	25947	25952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827355
558	NC_015423	CAA	2	6	25959	25964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827355
559	NC_015423	CGC	2	6	26010	26015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827355
560	NC_015423	GCGCG	2	10	26058	26067	0 %	0 %	60 %	40 %	330827355
561	NC_015423	GCC	2	6	26104	26109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827355
562	NC_015423	GGA	2	6	26136	26141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827355
563	NC_015423	CG	4	8	26147	26154	0 %	0 %	50 %	50 %	330827355
564	NC_015423	ACA	2	6	26201	26206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827355
565	NC_015423	AGG	2	6	26213	26218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827355
566	NC_015423	CTCG	2	8	26271	26278	0 %	25 %	25 %	50 %	330827355
567	NC_015423	CTA	2	6	26354	26359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827356
568	NC_015423	GAT	2	6	26381	26386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827356
569	NC_015423	AGC	2	6	26467	26472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827356
570	NC_015423	CG	4	8	26534	26541	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
571	NC_015423	GCC	2	6	26570	26575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827356
572	NC_015423	GAC	2	6	26621	26626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827356
573	NC_015423	GC	3	6	26641	26646	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
574	NC_015423	CGA	2	6	26749	26754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827356
575	NC_015423	TCA	2	6	26791	26796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827356
576	NC_015423	ACG	2	6	26812	26817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827356
577	NC_015423	GCA	2	6	26840	26845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827356
578	NC_015423	GGC	2	6	26853	26858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827356
579	NC_015423	CAA	2	6	26882	26887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827356
580	NC_015423	ACA	2	6	26914	26919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827356
581	NC_015423	ACC	2	6	26937	26942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827356
582	NC_015423	ACG	2	6	26986	26991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827356
583	NC_015423	AAC	2	6	27108	27113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827356
584	NC_015423	CAA	2	6	27152	27157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827356
585	NC_015423	AGG	2	6	27166	27171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330827356
586	NC_015423	GCT	2	6	27191	27196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827356
587	NC_015423	GCG	2	6	27249	27254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827356
588	NC_015423	CTG	2	6	27288	27293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827356
589	NC_015423	ATC	2	6	27336	27341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827356
590	NC_015423	GTT	2	6	27357	27362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330827356
591	NC_015423	GTG	2	6	27363	27368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827356
592	NC_015423	AGA	2	6	27400	27405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827356
593	NC_015423	ATG	2	6	27420	27425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827356
594	NC_015423	TCA	2	6	27466	27471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827356
595	NC_015423	ACC	2	6	27472	27477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827356
596	NC_015423	GC	5	10	27504	27513	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
597	NC_015423	GGC	2	6	27521	27526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827356
598	NC_015423	GGC	2	6	27581	27586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827356
599	NC_015423	CAT	2	6	27629	27634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827356
600	NC_015423	GAT	2	6	27674	27679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330827356
601	NC_015423	GCG	2	6	27702	27707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827356
602	NC_015423	GCAA	2	8	27714	27721	50 %	0 %	25 %	25 %	330827356
603	NC_015423	TCGG	2	8	27835	27842	0 %	25 %	50 %	25 %	330827356
604	NC_015423	GCA	2	6	27890	27895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827356
605	NC_015423	GCCG	2	8	27945	27952	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
606	NC_015423	ACATC	2	10	27976	27985	40 %	20 %	0 %	40 %	330827356
607	NC_015423	GC	3	6	28002	28007	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
608	NC_015423	GTG	2	6	28083	28088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827356
609	NC_015423	GGGT	2	8	28106	28113	0 %	25 %	75 %	0 %	330827356
610	NC_015423	TGG	2	6	28115	28120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827356
611	NC_015423	CGG	2	6	28180	28185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827356
612	NC_015423	CGG	3	9	28241	28249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827356
613	NC_015423	CG	3	6	28288	28293	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
614	NC_015423	GCG	2	6	28327	28332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827356
615	NC_015423	GAA	2	6	28361	28366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827356
616	NC_015423	GGC	2	6	28374	28379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827356
617	NC_015423	GTG	2	6	28384	28389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827356
618	NC_015423	TCA	2	6	28408	28413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827356
619	NC_015423	CG	3	6	28505	28510	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
620	NC_015423	CGTG	2	8	28634	28641	0 %	25 %	50 %	25 %	330827356
621	NC_015423	CCG	2	6	28652	28657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827356
622	NC_015423	CG	3	6	28757	28762	0 %	0 %	50 %	50 %	330827356
623	NC_015423	CCAA	2	8	28789	28796	50 %	0 %	0 %	50 %	330827356
624	NC_015423	CAA	2	6	28854	28859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827356
625	NC_015423	ACC	2	6	28863	28868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827356
626	NC_015423	GCA	2	6	28874	28879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827356
627	NC_015423	AAG	3	9	28980	28988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827356
628	NC_015423	CGG	2	6	29006	29011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827356
629	NC_015423	CCGCT	2	10	29014	29023	0 %	20 %	20 %	60 %	330827356
630	NC_015423	GAA	2	6	29093	29098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330827356
631	NC_015423	GCA	2	6	29104	29109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827356
632	NC_015423	GGGC	2	8	29181	29188	0 %	0 %	75 %	25 %	330827356
633	NC_015423	ACA	2	6	29212	29217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827356
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635	NC_015423	ACA	2	6	29305	29310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330827356
636	NC_015423	GCC	2	6	29325	29330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827356
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640	NC_015423	CAT	2	6	29691	29696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827357
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642	NC_015423	CGG	2	6	29872	29877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827357
643	NC_015423	TGC	2	6	29912	29917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827357
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647	NC_015423	GCC	2	6	30541	30546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827358
648	NC_015423	GC	3	6	30602	30607	0 %	0 %	50 %	50 %	330827358
649	NC_015423	GC	3	6	30616	30621	0 %	0 %	50 %	50 %	330827358
650	NC_015423	GCT	2	6	30750	30755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827358
651	NC_015423	CTG	2	6	30790	30795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827358
652	NC_015423	CGA	2	6	30807	30812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827358
653	NC_015423	CTG	2	6	30888	30893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827358
654	NC_015423	AGC	2	6	30904	30909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827358
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657	NC_015423	GCC	2	6	30940	30945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827358
658	NC_015423	TCC	2	6	30947	30952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330827358
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662	NC_015423	CTG	2	6	31291	31296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827359
663	NC_015423	CTG	2	6	31367	31372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827359
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690	NC_015423	TGCGC	2	10	32551	32560	0 %	20 %	40 %	40 %	330827362
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700	NC_015423	TTG	2	6	33028	33033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330827363
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702	NC_015423	TGC	2	6	33044	33049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827363
703	NC_015423	GCG	2	6	33050	33055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827363
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720	NC_015423	GCGG	2	8	33962	33969	0 %	0 %	75 %	25 %	330827365
721	NC_015423	CG	3	6	33991	33996	0 %	0 %	50 %	50 %	330827365
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733	NC_015423	GGC	2	6	34410	34415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827365
734	NC_015423	GAGCGC	2	12	34431	34442	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330827365
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738	NC_015423	GCTT	2	8	34713	34720	0 %	50 %	25 %	25 %	330827366
739	NC_015423	GTG	2	6	34721	34726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330827366
740	NC_015423	GCT	2	6	34769	34774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827366
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742	NC_015423	ACG	2	6	34842	34847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827366
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744	NC_015423	CTG	2	6	34859	34864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827366
745	NC_015423	CTG	2	6	34889	34894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330827366
746	NC_015423	CCAAG	2	10	34924	34933	40 %	0 %	20 %	40 %	330827366
747	NC_015423	CAT	2	6	35032	35037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827367
748	NC_015423	CAC	2	6	35042	35047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330827367
749	NC_015423	GCC	2	6	35060	35065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330827367
750	NC_015423	TCA	2	6	35184	35189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330827367
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752	NC_015423	ACG	2	6	35317	35322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330827368
753	NC_015423	GGC	2	6	35385	35390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330827368
754	NC_015423	GC	3	6	35409	35414	0 %	0 %	50 %	50 %	330827368
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1000	NC_015423	CT	3	6	47724	47729	0 %	50 %	0 %	50 %	330827383

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